Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GMDSO60547 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GMDSO60547 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GMDSO60547 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GMDSO60547 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GMDSO60547 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GMDSO60547 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GMDSO60547 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GMDSO60547 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GMDSO60547 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GMDSO60547 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GMDSO60547 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GMDSO60547 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GMDSO60547 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GMDSO60547 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GMDSO60547 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GMDSO60547 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GMDSO60547 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GMDSO60547 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GMDSO60547 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GMDSO60547 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GMDSO60547 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GMDSO60547 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GMDSO60547 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GMDSO60547 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GMDSO60547 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GMDSO60547 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GMDSO60547 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GMDSO60547 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GMDSO60547 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GMDSO60547 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GMDSO60547 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GMDSO60547 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GMDSO60547 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GMDSO60547 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GMDSO60547 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GMDSO60547 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GMDSO60547 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GMDSO60547 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GMDSO60547 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GMDSO60547 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GMDSO60547 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GMDSO60547 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GMDSO60547 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GMDSO60547 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GMDSO60547 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GMDSO60547 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GMDSO60547 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GMDSO60547 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GMDSO60547 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GMDSO60547 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GMDSO60547 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GMDSO60547 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GMDSO60547 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GMDSO60547 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
GMDSO60547 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GMDSO60547 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GMDSO60547 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GMDSO60547 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GMDSO60547 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GMDSO60547 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GMDSO60547 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GMDSO60547 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GMDSO60547 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GMDSO60547 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GMDSO60547 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GMDSO60547 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GMDSO60547 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GMDSO60547 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GMDSO60547 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GMDSO60547 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GMDSO60547 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GMDSO60547 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GMDSO60547 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GMDSO60547 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GMDSO60547 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GMDSO60547 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GMDSO60547 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GMDSO60547 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GMDSO60547 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GMDSO60547 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GMDSO60547 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GMDSO60547 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GMDSO60547 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GMDSO60547 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GMDSO60547 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GMDSO60547 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GMDSO60547 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GMDSO60547 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GMDSO60547 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GMDSO60547 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GMDSO60547 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GMDSO60547 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GMDSO60547 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GMDSO60547 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GMDSO60547 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GMDSO60547 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GMDSO60547 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GMDSO60547 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GMDSO60547 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms