Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CREB3O43889 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREB3O43889 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREB3O43889 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREB3O43889 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREB3O43889 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREB3O43889 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREB3O43889 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREB3O43889 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREB3O43889 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREB3O43889 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREB3O43889 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREB3O43889 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREB3O43889 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREB3O43889 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CREB3O43889 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREB3O43889 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREB3O43889 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREB3O43889 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREB3O43889 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREB3O43889 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREB3O43889 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREB3O43889 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREB3O43889 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREB3O43889 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREB3O43889 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREB3O43889 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CREB3O43889 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREB3O43889 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREB3O43889 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREB3O43889 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREB3O43889 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREB3O43889 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREB3O43889 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREB3O43889 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREB3O43889 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREB3O43889 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREB3O43889 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREB3O43889 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREB3O43889 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREB3O43889 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREB3O43889 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREB3O43889 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CREB3O43889 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB3O43889 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB3O43889 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB3O43889 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB3O43889 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB3O43889 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB3O43889 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB3O43889 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB3O43889 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB3O43889 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB3O43889 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB3O43889 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB3O43889 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB3O43889 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB3O43889 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB3O43889 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB3O43889 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB3O43889 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB3O43889 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB3O43889 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB3O43889 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB3O43889 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB3O43889 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB3O43889 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB3O43889 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB3O43889 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB3O43889 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB3O43889 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB3O43889 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB3O43889 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB3O43889 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB3O43889 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB3O43889 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB3O43889 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB3O43889 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB3O43889 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB3O43889 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB3O43889 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB3O43889 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CREB3O43889 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB3O43889 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB3O43889 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB3O43889 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB3O43889 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB3O43889 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB3O43889 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB3O43889 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB3O43889 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB3O43889 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB3O43889 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB3O43889 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB3O43889 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB3O43889 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB3O43889 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB3O43889 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB3O43889 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CREB3O43889 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms