Protein–RNA interactions for Protein: O43610

SPRY3, Protein sprouty homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRY3O43610 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPRY3O43610 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms