Protein–RNA interactions for Protein: O00507

USP9Y, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YO00507 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP9YO00507 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP9YO00507 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP9YO00507 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP9YO00507 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP9YO00507 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP9YO00507 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP9YO00507 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP9YO00507 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP9YO00507 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP9YO00507 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP9YO00507 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP9YO00507 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP9YO00507 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP9YO00507 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP9YO00507 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP9YO00507 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP9YO00507 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP9YO00507 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP9YO00507 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP9YO00507 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP9YO00507 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP9YO00507 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP9YO00507 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP9YO00507 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP9YO00507 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP9YO00507 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP9YO00507 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP9YO00507 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP9YO00507 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP9YO00507 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP9YO00507 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP9YO00507 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP9YO00507 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP9YO00507 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP9YO00507 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP9YO00507 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
USP9YO00507 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP9YO00507 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP9YO00507 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP9YO00507 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP9YO00507 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP9YO00507 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP9YO00507 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
USP9YO00507 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP9YO00507 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP9YO00507 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP9YO00507 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP9YO00507 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP9YO00507 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP9YO00507 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP9YO00507 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP9YO00507 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP9YO00507 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP9YO00507 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP9YO00507 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP9YO00507 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP9YO00507 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP9YO00507 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP9YO00507 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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USP9YO00507 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP9YO00507 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP9YO00507 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP9YO00507 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP9YO00507 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP9YO00507 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP9YO00507 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP9YO00507 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP9YO00507 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP9YO00507 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP9YO00507 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP9YO00507 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP9YO00507 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP9YO00507 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP9YO00507 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
USP9YO00507 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
USP9YO00507 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
USP9YO00507 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP9YO00507 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP9YO00507 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP9YO00507 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP9YO00507 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP9YO00507 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP9YO00507 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP9YO00507 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP9YO00507 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP9YO00507 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP9YO00507 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP9YO00507 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP9YO00507 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP9YO00507 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP9YO00507 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP9YO00507 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP9YO00507 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP9YO00507 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP9YO00507 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP9YO00507 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP9YO00507 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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