Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms