Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PATL2C9JE40 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms