Protein–RNA interactions for Protein: B7ZW38

HNRNPCL3, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPCL3B7ZW38 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HNRNPCL3B7ZW38 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms