Protein–RNA interactions for Protein: A6NL46

Putative UPF0607 protein ENSP00000332738, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NL46 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A6NL46 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A6NL46 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A6NL46 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
A6NL46 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A6NL46 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
A6NL46 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
A6NL46 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
A6NL46 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
A6NL46 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
A6NL46 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
A6NL46 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A6NL46 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A6NL46 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A6NL46 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A6NL46 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A6NL46 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A6NL46 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A6NL46 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
A6NL46 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A6NL46 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A6NL46 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A6NL46 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A6NL46 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
A6NL46 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A6NL46 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A6NL46 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A6NL46 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A6NL46 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A6NL46 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A6NL46 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
A6NL46 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A6NL46 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A6NL46 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A6NL46 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A6NL46 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A6NL46 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A6NL46 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A6NL46 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A6NL46 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A6NL46 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A6NL46 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A6NL46 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A6NL46 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A6NL46 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A6NL46 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A6NL46 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A6NL46 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A6NL46 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A6NL46 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A6NL46 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A6NL46 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
A6NL46 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A6NL46 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A6NL46 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A6NL46 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A6NL46 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A6NL46 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A6NL46 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A6NL46 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A6NL46 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A6NL46 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A6NL46 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A6NL46 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A6NL46 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A6NL46 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A6NL46 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
A6NL46 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A6NL46 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
A6NL46 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A6NL46 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A6NL46 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A6NL46 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A6NL46 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A6NL46 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A6NL46 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
A6NL46 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
A6NL46 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
A6NL46 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A6NL46 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A6NL46 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A6NL46 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A6NL46 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
A6NL46 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A6NL46 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A6NL46 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A6NL46 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A6NL46 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A6NL46 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A6NL46 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A6NL46 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A6NL46 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A6NL46 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A6NL46 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A6NL46 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
A6NL46 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A6NL46 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A6NL46 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A6NL46 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A6NL46 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms