Protein–RNA interactions for Protein: A6NE82

MBD3L3, Putative methyl-CpG-binding domain protein 3-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3L3A6NE82 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
MBD3L3A6NE82 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD3L3A6NE82 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms