Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms