Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2N7

HIF3A, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF3AQ9Y2N7 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms