Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms