Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms