Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms