Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGV2

NDRG3, Protein NDRG3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG3Q9UGV2 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms