Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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