Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms