Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHPF2Q9P2E5 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms