Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms