Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTPS2Q9NRF8 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms