Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LHX9Q9NQ69 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms