Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP56

PDE7B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7B, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7BQ9NP56 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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