Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUFT1Q9NNX1 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.1 ms