Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms