Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms