Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU4

SMURF2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2Q9HAU4 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms