Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AMBRA1Q9C0C7 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms