Protein–RNA interactions for Protein: Q9C040

TRIM2, Tripartite motif-containing protein 2, humanhuman

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Length 744 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM2Q9C040 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM2Q9C040 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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