Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE3

BARHL1, BarH-like 1 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL1Q9BZE3 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BARHL1Q9BZE3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms