Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCGF6Q9BYE7 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms