Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms