Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms