Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms