Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms