Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SYT17Q9BSW7 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYT17Q9BSW7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYT17Q9BSW7 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYT17Q9BSW7 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYT17Q9BSW7 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYT17Q9BSW7 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYT17Q9BSW7 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SYT17Q9BSW7 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SYT17Q9BSW7 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SYT17Q9BSW7 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYT17Q9BSW7 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYT17Q9BSW7 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYT17Q9BSW7 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SYT17Q9BSW7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYT17Q9BSW7 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYT17Q9BSW7 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYT17Q9BSW7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYT17Q9BSW7 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYT17Q9BSW7 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SYT17Q9BSW7 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYT17Q9BSW7 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms