Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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