Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms