Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LPIN3Q9BQK8 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LPIN3Q9BQK8 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LPIN3Q9BQK8 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LPIN3Q9BQK8 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LPIN3Q9BQK8 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LPIN3Q9BQK8 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LPIN3Q9BQK8 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LPIN3Q9BQK8 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LPIN3Q9BQK8 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LPIN3Q9BQK8 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LPIN3Q9BQK8 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LPIN3Q9BQK8 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LPIN3Q9BQK8 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
LPIN3Q9BQK8 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LPIN3Q9BQK8 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LPIN3Q9BQK8 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LPIN3Q9BQK8 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
LPIN3Q9BQK8 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LPIN3Q9BQK8 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LPIN3Q9BQK8 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LPIN3Q9BQK8 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LPIN3Q9BQK8 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LPIN3Q9BQK8 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
LPIN3Q9BQK8 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LPIN3Q9BQK8 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LPIN3Q9BQK8 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LPIN3Q9BQK8 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LPIN3Q9BQK8 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LPIN3Q9BQK8 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LPIN3Q9BQK8 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LPIN3Q9BQK8 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LPIN3Q9BQK8 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LPIN3Q9BQK8 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LPIN3Q9BQK8 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LPIN3Q9BQK8 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LPIN3Q9BQK8 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LPIN3Q9BQK8 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LPIN3Q9BQK8 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LPIN3Q9BQK8 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LPIN3Q9BQK8 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LPIN3Q9BQK8 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LPIN3Q9BQK8 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LPIN3Q9BQK8 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LPIN3Q9BQK8 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms