Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLF1Q9BQI6 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLF1Q9BQI6 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLF1Q9BQI6 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLF1Q9BQI6 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLF1Q9BQI6 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLF1Q9BQI6 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLF1Q9BQI6 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SLF1Q9BQI6 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLF1Q9BQI6 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLF1Q9BQI6 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLF1Q9BQI6 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLF1Q9BQI6 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLF1Q9BQI6 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLF1Q9BQI6 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLF1Q9BQI6 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLF1Q9BQI6 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SLF1Q9BQI6 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLF1Q9BQI6 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLF1Q9BQI6 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLF1Q9BQI6 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLF1Q9BQI6 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SLF1Q9BQI6 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLF1Q9BQI6 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SLF1Q9BQI6 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLF1Q9BQI6 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLF1Q9BQI6 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLF1Q9BQI6 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLF1Q9BQI6 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLF1Q9BQI6 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLF1Q9BQI6 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLF1Q9BQI6 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLF1Q9BQI6 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLF1Q9BQI6 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLF1Q9BQI6 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLF1Q9BQI6 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLF1Q9BQI6 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLF1Q9BQI6 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLF1Q9BQI6 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLF1Q9BQI6 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLF1Q9BQI6 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLF1Q9BQI6 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLF1Q9BQI6 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLF1Q9BQI6 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms