Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPS8Q99627 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms