Protein–RNA interactions for Protein: Q99616

CCL13, C-C motif chemokine 13, humanhuman

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Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL13Q99616 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL13Q99616 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL13Q99616 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL13Q99616 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL13Q99616 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL13Q99616 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL13Q99616 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL13Q99616 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL13Q99616 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL13Q99616 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL13Q99616 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL13Q99616 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL13Q99616 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL13Q99616 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL13Q99616 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL13Q99616 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL13Q99616 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL13Q99616 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL13Q99616 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL13Q99616 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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CCL13Q99616 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL13Q99616 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL13Q99616 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL13Q99616 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL13Q99616 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL13Q99616 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL13Q99616 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL13Q99616 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL13Q99616 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL13Q99616 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL13Q99616 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL13Q99616 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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CCL13Q99616 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL13Q99616 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL13Q99616 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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CCL13Q99616 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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CCL13Q99616 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CCL13Q99616 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CCL13Q99616 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL13Q99616 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CCL13Q99616 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL13Q99616 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CCL13Q99616 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL13Q99616 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CCL13Q99616 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CCL13Q99616 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL13Q99616 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CCL13Q99616 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL13Q99616 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL13Q99616 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL13Q99616 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL13Q99616 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL13Q99616 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL13Q99616 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL13Q99616 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL13Q99616 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL13Q99616 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCL13Q99616 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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