Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms