Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDRT15Q96T59 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDRT15Q96T59 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDRT15Q96T59 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CDRT15Q96T59 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDRT15Q96T59 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDRT15Q96T59 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDRT15Q96T59 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CDRT15Q96T59 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDRT15Q96T59 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDRT15Q96T59 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDRT15Q96T59 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CDRT15Q96T59 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDRT15Q96T59 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDRT15Q96T59 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms