Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC9Q96Q05 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms