Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms