Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms