Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAF2Q96CS3 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms