Protein–RNA interactions for Protein: Q96BA8

CREB3L1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L1Q96BA8 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREB3L1Q96BA8 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms