Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMARCE1Q969G3 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms