Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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GTF3C6Q969F1 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
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GTF3C6Q969F1 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
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GTF3C6Q969F1 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
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GTF3C6Q969F1 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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GTF3C6Q969F1 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
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GTF3C6Q969F1 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
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GTF3C6Q969F1 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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